行政职能科室：院办公室、党建办公室、工会、人事科、财务科、医务科、护理部、感染科、药械科(下设药库、门诊西药房、中药房、住院药房、煎药室）、信息科、合管办、病案室、总务科（下设总务科、洗衣房、被服仓库）、公共卫生科、保卫科。

医技科室：磁共振室、CT室、放射科、检验科、超声科、心电图室、彩色经颅多普勒室、病理科。

内科科室：内一（情志科）、内二（肝胆脾胃病科）、内三科（心血管科）、内六科（脑血管病科）、内五科（肿瘤血液病科）、内七科（内分泌科）、介入科、儿科、急诊科。

外科科室：外一（普外、泌尿、显微外科）、外二（骨伤、关节镜、颅脑外科）、外三（脊柱微创外科）、妇产科、儿科。

门诊科室：脑血管病科、心血管病科、肝胆脾胃病科、外一（普通外科）、外二（骨伤外科）、外三（脊柱微创外科）、肾病科、内分泌糖尿病科、情志科、老年病科、妇产科、儿科、针灸科、康复科、不孕不育科、疼痛科、眼科、耳鼻喉科、口腔科、皮肤科、风湿免疫科、乳腺科、碎石科、治未病科、疼痛科。

特色科室：脑病科（省级特色专科）、针灸科（新乡市重点专科）。

手术室、急救120